| Нұсқа | 4.5 |
|---|---|
| Баспа | Bioinformatics Solutions |
| Шығару күні | 2010 ж. 10 мам. |
| Қосылған күн | 2010 ж. 16 шіл. |
| Os талаптары | Windows XP/Vista/7 |
| Талаптар | None |
| Жалпы жүктеулер | 9 464 |
| Аптасына жүктеулер | 9 |
| Бағасы | Free |
Сипаттама
RAPTOR - бұл ақуыз құрылымын дәл болжауға арналған инновациялық бағдарлама. Ол жетілдірілген талдау құралдарын бір интеграцияланған бағдарламалық жасақтама шешімінде біріктіреді және үш түрлі бұрау әдістерін ұсынады. RAPTOR-дің бірегей бүтін программалауды оңтайландыру тәсілі гомологиясы төмен нысандардың құрылымдық шаблондарын табуда тиімді және жоғары сапалы модельдер құруға қабілетті. Пайдалануға қарапайым интерфейс және түсінуге оңай E мәндері жаңадан бастаушылар мен сарапшылар үшін өте қолайлы. Ең бастысы, нәтиженің интуитивті көрінісі пайдаланушыларға нәтижелерді қарапайым көзқараспен түсінуге мүмкіндік береді. Мақсатты ақуыздар тізбегін ескере отырып, егер белгілі 3D құрылымы бар гомологты ақуыз болса, оны РАПТОР-да келтірілген PSI-BLAST сияқты дәйекті іздеу құралдарының көмегімен табуға болады. Мақсат құрылымы содан кейін белгілі құрылымнан құрастырылады; дегенмен, кезектілік гомологиясы маңызды болмаған кезде, яғни 25% -дан аз болған кезде, PSI-BLAST сенімді соққы бере алмайды. PSI-BLAST-тен айырмашылығы, жай іздеуді жүзеге асырады, ақуызды жіптеу, қатпарды тану гомологияны да, құрылым туралы ақпаратты да пайдаланады. Ол белгісіз құрылымы бар белоктар тізбегін белгілі құрылымдар туралы мәліметтер базасына қарап шығады. Скорингтік функцияны қолдану және үш өлшемді құрылымдар мен сызықтық ақуыздар тізбегі арасындағы үйлесімділікті талдау арқылы тізбектің құрылымын құруға болатын ең жақсы құрылымдық шаблон анықталады. Нәтижесінде, белоктық жіптер гомологиялық модельдеуге қарағанда шекті реттілік гомологиясы болған кездегі болжамды жақсырақ береді.
