Sequencher for Mac 5.4.6

Mac жүйесіне арналған Sequencher: ДНҚ ретін талдаудың соңғы құралы

Егер сіз өмір туралы ғылымды зерттеуші болсаңыз, сізде дұрыс құралдардың болуы қаншалықты маңызды екенін білесіз. Ал ДНҚ реттілігін талдауға келетін болсақ, Mac жүйесіне арналған Sequencher-тен жақсы құрал жоқ.

Sequencher – бұл барлық автоматтандырылған ДНҚ секвенсерлерімен жұмыс істейтін білім беру бағдарламалық құралы және өзінің найзағай жылдам контиг жинағымен, қысқа оқу қисығымен, пайдаланушыға ыңғайлы өңдеу құралдарымен және тамаша техникалық қолдауымен кеңінен танымал. Алғаш рет 15 жыл бұрын шығарылған Sequencher әрбір ірі геномдық және фармацевтикалық компанияда, сондай-ақ әлемнің 40-тан астам еліндегі көптеген академиялық және үкіметтік зертханаларда дәйектілікті талдау тапсырмаларына арналған бағдарламалық құрал болды.

Бірақ Sequencher нені соншалықты ерекше етеді? Оның мүмкіндіктерін толығырақ қарастырайық.

De Novo гендердің реттілігі

ДНҚ тізбегін талдаудың ең көп тараған қолданбаларының бірі гендердің секвенирленуі болып табылады. Бұл бастапқы реттілік деректеріне негізделген толық генді нөлден жинауды қамтиды. Sequencher көмегімен бұл процесс тіпті ең күрделі тізбектерді өңдей алатын қуатты контигті құрастыру алгоритмдерінің арқасында жеңілдетілген.

Мутацияны анықтау

ДНҚ тізбегін талдаудың тағы бір маңызды қолданбасы мутацияны анықтау болып табылады. Ауру тудыратын мутацияларды іздеп жатсаңыз немесе әртүрлі популяциялар арасындағы генетикалық вариацияларды анықтауға тырыссаңыз да, Sequencher сізге гетерозигота мен SNP анықтау және талдаудың жетілдірілген мүмкіндіктерін ұсынады.

Адамның криминалистикалық идентификациясы

Сот-медициналық ғылымда ДНҚ секвенциясы қылмыстық тергеуде адам қалдықтарын немесе күдіктілерді анықтауда шешуші рөл атқарады. Sequencher сенімділік ұпайлары мен GenBank мүмкіндіктерін импорттауды қолдауымен сот сарапшылары ықтимал сәйкестіктерді анықтау үшін секвенирлеу деректерінің үлкен көлемін жылдам талдай алады.

Салыстырмалы реттілік

Салыстырмалы реттілік олардың арасындағы ұқсастықтар мен айырмашылықтарды анықтау үшін екі немесе одан да көп тізбектерді салыстыруды қамтиды. Бұл эволюциялық биология немесе дәрі-дәрмектің ашылуын зерттеу сияқты салаларда пайдалы болуы мүмкін, мұнда зерттеушілер әртүрлі түрлер немесе штаммдар бойынша генетикалық тізбектерді салыстыру қажет. Sequencher салыстырмалы реттілік мүмкіндіктерімен бұл процесс әлдеқайда жеңіл және тиімдірек болады.

Сенімділік ұпайларын қолдау

Сенімділік көрсеткіштері деректерді реттілік талдау кезінде көптеген зерттеушілер пайдаланатын маңызды көрсеткіш болып табылады. Бұл ұпайлар сапа ұпайлары немесе оқу тереңдігі сияқты әртүрлі факторларға негізделген белгілі бір негізгі қоңыраудың немесе туралаудың дұрыс екеніне қаншалықты сенімді екенін көрсетеді. Өзінің алгоритмдеріне енгізілген сенімділік ұпайларына қолдау көрсете отырып, Sequnecer жоғары дәлдік деңгейін сақтай отырып, үлкен көлемдегі деректерді талдауды жеңілдетеді.

ORF аудармасы

Ашық оқу шеңберлері (ORFs) - белоктарды кодтайтын гендегі нуклеотидтердің созылуы. Геном ішіндегі ORF анықтау қиын болуы мүмкін, бірақ Sequnecer-тің ORF аударма мүмкіндіктері арқылы зерттеушілер бұл аймақтарды гендік функцияны жақсырақ түсінуге мүмкіндік беретін реттіліктерінде оңай таба алады.

GenBank мүмкіндіктерін импорттау

GenBank мүмкіндіктері гендер туралы құнды ақпаратты, соның ішінде олардың хромосомалар ішіндегі орналасуын және басқа да аннотацияларды, мысалы, экзондар/интрондар, т.б. қамтамасыз етеді. Бұл мүмкіндіктерді Sequnecer-ке импорттау арқылы пайдаланушылар праймер сияқты төменгі ағындық талдаулар кезінде неғұрлым саналы шешім қабылдауға көмектесетін тізбектері туралы қосымша ақпаратқа қол жеткізе алады. дизайн және т.

Шектеу ферментінің картасы

Шектеу ферменттері екі тізбекті ДНҚ-ны белгілі бір тану орындарында кесіп, оларды геномдық құрылымды/функцияны зерттеу кезінде пайдалы құрал етеді. т.б..

Қорытынды:

Қорытындылай келе, егер сіз өмір туралы ғылымды зерттеуді оңтайландыруға көмектесетін білім беру бағдарламалық құралын іздесеңіз, онда Sequnecer-тен басқаны іздемеңіз! Пайдаланушыға ыңғайлы интерфейспен біріктірілген оның қуатты алгоритмдері тәжірибелі зерттеушілерге қажет кеңейтілген функционалдылықты қамтамасыз ете отырып, тіпті жаңадан бастаған пайдаланушыларға да жылдам іске қосуды жеңілдетеді. Олай болса, неге күту керек? Көшірмені бүгін жүктеп алыңыз!